企业出资人权益确认纠纷，是指企业出资人之间或者企业出资人与企业之间就出资权益是否存在或者持有比例多少发生争议时，出资人（包括自然人、法人或其他组织）诉请人民法院确认其享有企业一定出资权益的纠纷。
出资人权益是指企业（包括国有企业和其他所有制类型企业在内）出资方在企业中享有的资产收益、最大决策以及选择经营管理者等权利。该权益内容由法律规定和企业规章来确定。
根据《民事诉讼法》的规定，因企业出资人权益确认纠纷提起的诉讼由被告住所地人民法院法院管辖。
对于国有企业的出资人， 《物权法》第55条规定了出资人权益：国家出资的企业，由国务院、地方人民政府依照法律、行政法规规定分别代表国家履行出资人职责，享有出资人权益。《公司法》第65条第2款明确了国有独资公司是由国务院或地方人民政府授权本机人民政府国有资产监督管理机构履行出资人职责。另有相关条文规定，国务院及各级地方人民政府分别设立国有资产监督管理机构。国有资产监督管理机构根据授权，已发履行出资人职责，依法对企业国有资产进行监督管理。国务院代表国家对关系国民经济命脉和国家安全的大型国有及国有控股、国有参股企业、重要基础设施和重要自然资源等领域的国有及国有控股、国有参股企业，履行出资人职责。
对于非国有企业的出资人， 《物权法》第67条也规定：“国家、集体和私人依法可以出资设立有限责任公司、股份有限公司或者其他企业。国家、集体和私人所有的不动产或者动产，投到企业的，由出资人按照约定或者出资比例享有资产收益、重大决策以及选择经营管理者等权利并履行义务。” 《公司法》第15条规定：“公司可以向其他企业投资，但是，除法律另有规定的外，不得成为对所投资企业的债务承担连带责任的出资人。”
在相关问题的法律适用中，处理企业出资人权益确认纠纷的法律依据主要是《物权法》第55条、第67条，《公司法》第15条、第65条，《中小企业促进法》第6条，《企业国有资产监督管理暂行条例》（2003年5月27日施行），外经贸部、国家工商行政管理局《中外合资经营企业合营各方出资的若干规定》（1988年3月1日实施），《<中外合资经营企业合资各方出资的若干规定>的补充规定》（1997年9月29日施行），以及最高人民法院《关于审理与企业改制相关的民事纠纷案件若干问题的规定》的相关规定。
此外对于该案由还应当注意，根据《民事诉讼法》关于诉的种类的划分，“企业出资人权益确认纠纷”俗语确认之诉，即请求人民法院确认当事人之间一定法律关系或确认当事人相应民事权利的诉讼。企业出资人权益确认之诉的目的在于确认当事人是否享有所争议的出资权益，属于对财产权属的确认之诉。诉讼当事人应提供出资证明文件、公司章程和工商登记等证据材料来主张其权利。实践中存在着当事人之间约定由一方名义出资、一方实际出资的情形，实际出资人向企业主张权利的，需首先提起确权之诉。